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Se desconoce la causa exacta de la mayor铆a de los tipos de c谩ncer vaginal o de vagina. Sin embargo, los cient铆ficos han determinado que est谩 asociada con varias afecciones descritas en la secci贸n Factores de riesgo del c谩ncer de vagina. Actualmente, se est谩 llevando a cabo una investigaci贸n para conocer m谩s sobre la forma en que estos factores de riesgo causan que las c茅lulas de la vagina se conviertan en c茅lulas cancerosas.

Aproximadamente el 75 % de los casos de c谩ncer de vagina se debe al virus del papiloma humano (VPH). La investigaci贸n ha demostrado que las c茅lulas sanas o normales producen sustancias llamadas productos de genes supresores de tumores, que les impiden crecer demasiado r谩pido y convertirse en c谩ncer. Los tipos de alto riesgo del VPH (virus del papiloma humano o papilomavirus humano), como el VPH 16 y el VPH 18) producen dos prote铆nas (E6 y E7) que pueden cambiar la manera en que funcionan los productos de genes supresores de tumores. Cuando esto sucede, los productos gen茅ticos supresores de tumores ya no pueden controlar el crecimiento de las c茅lulas normales o sanas que se convierten en cancerosas.

Las mujeres que estuvieron expuestas al dietilestilbestrol (DES) (informaci贸n en ingl茅s) cuando estaban en el 煤tero materno (es decir, sus madres tomaron el DES durante el embarazo) tienen un mayor riesgo de padecer carcinoma vaginal de c茅lulas claras. Con el dietilestilbestrol tambi茅n aumenta la probabilidad de que aparezca adenosis vaginal (c茅lulas glandulares presentes en el revestimiento de la vagina en lugar de las c茅lulas escamosas habituales). La mayor铆a de las mujeres con adenosis vaginal nunca presenta carcinoma de c茅lulas claras de vagina. Aun as铆, las mujeres que tienen un tipo raro de adenosis llamado adenosis tuboendometrial at铆pica corren un mayor riesgo de padecer este c谩ncer.